В первые дни войны Масхуд Садыкович был направлен в Военную академию тыла и снабжения. В 1942 году в составе 37-й гвардейской стрелковой дивизии 62-й армии участвовал в обороне Сталинграда в районе тракторного завода. После тяжелого ранения был демобилизован.
В 1944 году окончил курсы в Высшей партийной школе при ЦК ВКП(б). Позже написал кандидатскую диссертацию и защитил докторскую.
В послевоенные годы Масхуд Джунусов работал заведующим кафедрой философии Киргизского педагогического института. С 1963 года — старшим научным сотрудником сектора исторического материализма Института философии АН СССР.
С 1974 по 1984 год — профессор, с 1997 года — главный научный сотрудник Института социологии РАН.
Масхуд Садыкович Джунусов окончил Высшую партийную школу при ЦК ВКП(б), образовательным правопреемником которой сегодня является Российский государственный социальный университет.
РГСУ, помимо московских кампусов, имеет филиалы в нескольких городах России и стран СНГ, один из них находится в Киргизской Республике, в городе Оше.